устанавливаем exim с поддержкой exiscan, при этом у exim появляется новая опция конфига - av_scanner
av_scanner = clamd:127.0.0.1 3310

далее пишем

# в главной секции пишем acl
acl_smtp_data = acl_check_virus
# в секции описания acl
acl_check_virus:
        deny  message   = Message rejected: virus found.
        hosts       = *
        demime   = *
        malware  = *
        accept

есть еще интересная опция acl_check_content, но я ее пока не смотрел.